Локк проводит в Нидерландах пять лет подряд — с 1683 по 1689 год. Бежит из Англии при Карле II и затем Якове II, когда его связи с политической оппозицией делают дальнейшее пребывание на родине откровенно опасным для свободы, а возможно, и для жизни.
В Нидерландах он не сидит без дела. Пишет «Опыт о человеческом разумении», «Письмо о веротерпимости», готовит к изданию «Два трактата о правлении».
«Два трактата» — прямой ответ на аргументы роялистов о божественном праве королей на власть. Локк доказывает шаг за шагом: власть исходит не от Бога напрямую, а от согласия управляемых, которое может быть отозвано. Правительство, систематически нарушающее естественные права подданных, теряет легитимность как таковую, независимо от происхождения власти.
Он возвращается в Англию в феврале 1689 года — прямо с флотом Вильгельма Оранского, высадившегося на английском берегу. Яков II бежит без сопротивления. Начинается то, что позже назовут Славной революцией.
Его книги выходят почти одновременно с самими революционными событиями. «Два трактата» публикуются анонимно в конце 1689 года. Локк не признаёт собственного авторства до конца жизни, предпочитая оставаться в тени собственного текста.
Когда американские основатели пишут спустя почти век Декларацию независимости, они почти дословно пересказывают локковские формулировки. «Жизнь, свобода и стремление к счастью» — прямой парафраз его же «жизни, свободы и собственности», слегка изменённый под новый контекст.
Текст, написанный в вынужденной эмиграции, становится в итоге фундаментом сразу двух революций, разделённых веком и океаном.