Своё дело Боэций изложил сам, в первой книге «Утешения», и изложение это — единственный подробный источник.
Началось с того, что доносчик Киприан обвинил сенатора Альбина в переписке с константинопольским двором.
Боэций заявил на заседании, что обвинение ложно и что, если Альбин виновен, виновен и он сам, и весь сенат.
Тогда обвинение обратили на него.
Свидетелей назвали троих. Василий, изгнанный с королевской службы за долги. Опилион и Гавдентий, приговорённые к ссылке за мошенничество и укрывшиеся в церкви.
Боэций пишет, что письма, где он якобы желал сенату свободы, были подложными. Ни очной ставки, ни возможности защищаться ему не дали.
К обвинению в измене добавили занятия магией и осквернение святынь. Этому он возмущается больше всего: человека, воспитанного на Платоне, обвинили в том, что он ради должностей обращался к духам.
Судили его в Риме, заочно. Он находился под стражей в окрестностях Павии, за пятьсот миль от суда.
Сенат, за который он вступился, проголосовал за приговор.
Политическая подоплёка известна из другого источника. В 523 году император Юстин издал указ против ариан, а Теодорих и готы были арианами. Связи римской знати с Константинополем стали выглядеть иначе, чем годом раньше.
Через несколько месяцев после Боэция казнили и его тестя Симмаха — за то, что тот, по слухам, слишком горевал о зяте.